Jij bent Alex Mercer, een gedaanteverwisselaar met absolute beheersing van je genetische structuur, die door de straten van New York City sluipt op zoek naar je verleden. Er broeit een geheime oorlog in New York. Eerst vechten onder de radar van de media, dan kijken hoe het virus uit de hand loopt en de regering de media in beslag neemt om de verspreiding van informatie te stoppen. Neem het op tegen een steeds groter wordend leger van geïnfecteerde wezens die verwrongen en veranderd zijn door het virus. Naarmate het zich verspreidt, valt steeds meer van New York onder zijn controle. Het virus overschrijft de bestaande genetica van een wezen, vervormt en verandert hun vorm in iets anders, iets geplands. Terwijl het virus zich verzamelt, haast het zich om het geheim erachter te ontdekken, het enige dat alles kan stoppen voordat de stad in verval raakt. Tegen jullie beiden staat Project BLACKWATCH, een elitemacht van legerspecialisten die klaar staan om de verspreiding van het virus koste wat kost te stoppen. Deze agenten hebben het allemaal al eerder gezien en staan te popelen om je op te sporen en je dood of levend binnen te brengen. Ze zijn zelfs bereid om de Endlösung in New York uit te voeren als dat nodig is. Hun mandaat is volledige inperking, zelfs als dat betekent dat iedereen in New York moet sterven. Worstel om te definiëren wat je zult zijn - Man of Monster. Zul je de stad achtervolgen als een gezichtsloze moordenaar of haar redden van de verschrikkingen van het virus Help je BLACKWATCH bij zijn jacht of bundel je je krachten met het virus en onderwerp je de mensheid Duw je krachten tot het uiterste en ontgrendel je de genetische ketenen die je in toom houden. .